Ցիպրոֆլոքսացինը պատկանում է քինոլոնների դասին և ունի հակաբակտերիալ ազդեցություն Enterobacter, Pseudomonas aeruginosa, Haemophilus influenzae, Neisseria gonorrhoeae, Streptococcus, Legionella և Staphylococcus aureus-ի դեմ: Ցիպրոֆլոքսացինն ունի լայն սպեկտրի հակաբակտերիալ ակտիվություն և լավ մանրէասպան ազդեցություն: Գրեթե բոլոր մանրէների հակաբակտերիալ ակտիվությունը 2-ից 4 անգամ ավելի ուժեղ է, քան նորֆլոքսացինի և էնոքսացինի ակտիվությունը: